c++编译有关问题,大神们进

c++编译问题,大神们进!
编译autodock程序,autodock源代码里readme的讲解是:

The general process is:

 "cd" to autodock source directory
 "autoreconf -i"  [ optional, see below: "Modifying AutoDock and AutoGrid" ]
 "mkdir" and "cd" to your architecture's build directory (such as x86_64Linux3)
 ../configure    (* see below)
 make
    On Microsoft Windows when building for MINGW within Cygwin, 
    you need to type here:   rm .deps/*; ../configure
    to run "configure" a second time for reasons we do not understand.
 make check  (optional but recommended, requires "python")
 make install (optional, this will install autodock4 executable)

但是我按上面的方法编译却遇到了问题,编译内容如下:

[root@localhost autodock]# cd /root/src/autodock
[root@localhost autodock]# autoreconf -i
[root@localhost autodock]# mkdir x86_64Linux3
[root@localhost autodock]# ../configure
bash: ../configure: 没有那个文件或目录

怎么弄,求解!
------解决思路----------------------
mkdir x86_64Linux3 && cd x86_64Linux3