DCMTK 开源库的学习二:直接操作dcm文件中像素数据的尝试
DCMTK 开源库的学习2:直接操作dcm文件中像素数据的尝试
通过尝试,生成的test_decompressed.dcm"的传输语义,transferSyntex发生了改变,且像素数据区中的数据就代表了dcm图像中的真实像素值。利用UltraEdit等二进制编辑软件打开后一目了然:
DCMTK官网给出了JPEG格式压缩的DCM文件解压缩的方法(http://support.dcmtk.org/docs/mod_dcmjpeg.html),代码摘录如下:
DJDecoderRegistration::registerCodecs(); // register JPEG codecs DcmFileFormat fileformat; if (fileformat.loadFile("test_jpeg.dcm").good()) { DcmDataset *dataset = fileformat.getDataset(); // decompress data set if compressed dataset->chooseRepresentation(EXS_LittleEndianExplicit, NULL); // check if everything went well if (dataset->canWriteXfer(EXS_LittleEndianExplicit)) { fileformat.saveFile("test_decompressed.dcm", EXS_LittleEndianExplicit); } } DJDecoderRegistration::cleanup(); // deregister JPEG codecs
通过尝试,生成的test_decompressed.dcm"的传输语义,transferSyntex发生了改变,且像素数据区中的数据就代表了dcm图像中的真实像素值。利用UltraEdit等二进制编辑软件打开后一目了然:
原本压缩的像素数据区,被解压了出来:30 F8 30 F8 30 F8……,dcm文件中每个像素用16位来表示,采用的小端存储模式,30 F8就是十进制的-2000,即测试图像的填充背景的CT值。
博文(http://support.dcmtk.org/wiki/dcmtk/howto/accessing-compressed-data)给出了过去解压后的真实像素数据内存指针的方法,主要是的语句是:
DcmElement* element = NULL;
result = data->findAndGetElement(DCM_PixelData, element);
if (result.bad() || element == NULL)
return 1;
short* pixData;
result = element->getUint8Array(pixData);
此时pixData就指向了上图中的30 F8 30 F8 30 F8像素数据区的首地址。至此可以直接对dcm的像素进行操作,如下图是对其进行二值化的结果:
此处有一个问题未能解决:如果在对pixData指向的区域进行操作后,调用保存函数saveFile时未选择EXS_LittleEndianExplicit格式,生成的结果依然是原始图像。