自定义ClassLoader在Tomcat中的有关问题

自定义ClassLoader在Tomcat中的问题
公司要求做加密，于是上网搜啊，都说加密重要的.class，自定义ClassLoader加载加密的class，其实我感觉也没有用，defineClass时还是要解密。但是其间遇到一个问题一直不知道什么原因：

Jdk1.6  Tomcat5.5
自定义的ClassLoader类：MyClassLoader
待解密的类：LicenseUtils
我用MyClassLoader加载LicenseUtils时的代码：

Class c = loadClass("xx.LicenseUtils"));
Method m = c.getDeclaredMethod("init", new Class[]{});
m.invoke(c.newInstance(), new Object[]{});

LicenseUtils类中init方法：

public void init() {
    System.out.println("init method");
}

这么写是没有问题的，但是如果我在init方法里面调用第三方类（不是系统的类），就会出现ClassNotFoundException，找了半天也不知道什么原因，而且仅仅是在Tomcat里面运行出错，在main方法里面做测试是木有问题的。

public void init() {
    //自定义的类 License
    com.test.encrypt.License lic = new com.test.encrypt.License();
    //如果是第三方的jar包也报错
    System.out.println("init method");
}

我思忖，Java Application 和 Web Application有什么区别呢？
Jdk有三个ClassLoader，利用委派方式加载类，Tomcat定制了自己一系列的ClassLoader来加载类，我自己写
的MyClassLoader继承自Jdk的ClassLoader，Tomcat的WebAppClassLoader继承自URLClassLoader，URLClassLoader又继承自ClassLoader。

查了Apache的Mailing Lists发现有人说Tomcat只能用继承自WebAppClassLoader的ClassLoader

有人遇到过吗？或者看出有什么问题的